Nos résidents présentent régulièrement leur recherche dans un cycle organisé par le Comité des résidents.

Ce soir : Développements récents de la bio-informatique pour l’investigation de la régulation génétique

07 Mars 2018 – Théâtre Lúcio Costa –   20h30

DÉVELOPPEMENTS RÉCENTS DE LA BIO-INFORMATIQUE POUR
L’INVESTIGATION DE LA RÉGULATION GÉNÉTIQUE

ÉTUDE DE LA RELATION ENTRE STRUCTURE SPATIALE DES CHROMOSOMES ET POSITIONS DES SÉQUENCES RÉPÉTÉS LE LONG DES GÉNOMES

Léopold CARRON (Maison Cambodge) – Doctorant en 2ème année en Bioinformatique au Laboratoire Physique Théorique de la Matière Condensé, Sorbonne Université – Master 2 Apprentissage et Traitement Automatique de la Langue, Université de Nantes – Master Science et Vie de l’Environnement mention Bioinformatique et Génomique, Université de Rennes – Licence de Biologie mention Mathématique et Informatique du Vivant, Université Lyon 1

Toutes les cellules de notre corps contiennent le même patrimoine génétique. Pour qu’un gène soit exprimé dans une cellule, il faut que la région d’ADN codant ce gène soit dé-condensée. La condensation de l’ADN dans le noyau est aujourd’hui principalement expliquée par l’effet de modification bio-chimiques sur l’ADN et de protéines qui se fixant sur des régions appelé régulatrices. Parmi les séquences régulatrices, beaucoup d’entre elles se trouvent catégorisé dans ce qui était jusqu’alors considéré comme des séquences inutiles : les éléments transposables. Les éléments transposables sont un type de séquences répétées ayant la possibilité de se déplacer et de se dupliquer dans le génome. L’objectif de cette présentation est d’aborder les liens entre la position de ces éléments sur le génome et la condensation de l’ADN, visible en observant le génome par des méthodes de cartes de contacts chromosomiques.

IDENTIFICATION OF GENE REGULATORY NETWORKS IN ONCOGENE-INDUCED SENESCENCE

José Américo N LEVA F DE FREITAS* Doctorant en Biologie Cellulaire à l’Université Paris 7 et Institut Pasteur. Master en Ingénierie Biomedicale et Diplômé en Ingénierie Informatique à l’Université d’État de Campinas.

Cellular senescence (CS) is a process characterized by a stable arrest of cell proliferation. Although it is associated with age-related pathologies and tissue dysfunction, CS also acts as tumor suppressor mechanism and has been related to embryo development and tissue regeneration. This mechanism is regulated by several genes that can be activated or inhibited in response to the presence of specific proteins called transcription factors (TF). In this talk, I’ll present results from a time-course study that support the hypothesis that TFs act hierarchically: a set of pioneer TFs that regulate several genes is necessary for the activity of a set of specific migrant TFs. This study will provide a deeper understanding of CS and the opportunity to identify possible targets for senescence-modulating therapies.